生態環境中心以“國家生態環境安全與可持續發展”爲戰略主題，充分發揮環境科學、環境工程和生態學三大學科的綜合優勢，將國際環境科學與生態學研究前沿與國家環境保護與生態建設的重大需求緊密結合，不斷突破關系到國家生態安全、環境健康和可持續發展的重大科學理論和關鍵技術，爲我國生態文明建設、實現人與自然和諧共生做出基礎性、戰略性、前瞻性科技創新貢獻，將生態環境中心建設成爲我國生態環境科學應用基礎研究和技術創新基地、高級專門人才培養基地，成爲國內一流、國際上有重要影響的生態環境科學與技術綜合性研究機構。
2022年，生态环境中心坚持以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，学习宣传贯彻党的二十大精神，深入贯彻落实“四个率先”和“两加快一努力”目标要求，始终牢记“国家队”“国家人”的职责和使命，围绕“十四五”规划，聚焦主责主业、狠抓工作落实，积极承担国家重大科技任务，着力推进国重实验室重组，全力统筹各项工作全面协调发展，为国家生态文明建设和美丽中国建设提供了重要科技支撑。中心“十四五”规划和任务书首批获得中科院批复，在资源生态环境领域排名第一；探索研究所深化改革的体制机制，“深化科研院所改革 提升原始创新能力”改革试点任务书顺利通过院审批；中心“十四五”取得良好开局，新牵头承担国家重点研发计划“典型脆弱生态系统保护与修复”“长江黄河等重点流域水资源与水环境综合治理”和“大气与土壤、地下水污染综合治理”专项9个项目，课题20项；牵头承担国家自然科学基金“大气霾化学”基础科学中心项目；牵头承担科技部第二次青藏科考研究任务三“生态系统与生态安全”“污水新冠病毒监测预警体系构建与示范”应急项目课题2项；在“京津冀协同发展”、黄河流域生态保护和高质量发展、污染防治攻坚战、科技支撑“一带一路”倡议中发挥重要支撑作用。
生態環境中心共有11個實驗室，其中3個國家重點實驗室、1個國家工程研究中心和2個院重點實驗室。分別是環境化學與生態毒理學國家重點實驗室、環境水質學國家重點實驗室（環境模擬與汙染控制國家重點聯合實驗室）、城市與區域生態國家重點實驗室等3個國家重點實驗室，工業廢水無害化與資源化國家工程研究中心，中國科學院環境生物技術重點實驗室和中國科學院飲用水科學與技術重點實驗室等2個中科院重點實驗室；另有大氣環境與汙染控制實驗室、水汙染控制實驗室、土壤環境科學與技術實驗室、環境納米技術與健康效應重點實驗室、固體廢棄物處理與資源化實驗室等5個所級實驗室。設有文獻信息與學術傳播中心、大型分析儀器實驗室、二惡英實驗室、水質分析實驗室和北京城市生態系統研究站。組建有“持久性有毒汙染物形態、環境過程與毒理效應”“環境微界面過程與汙染控制”“土地利用與生態過程”“持久性有毒汙染物的環境過程與毒理效應”和“環境汙染與健康危害”等5個國家基金委創新研究群體和“持久性有毒化學汙染物”“生態系統過程與服務”“飲用水安全”等3個中國科學院創新研究團隊。二惡英實驗室爲國家實驗室認可和計量認證實驗室、水質分析實驗室爲計量認證實驗室；聯合國環境規劃署持久性有機汙染物分析示範實驗室落戶生態環境中心、住房和城鄉建設部農村汙水處理技術北方研究中心依托生態環境中心、國家林業和草原局-中國科學院國家公園研究院依托生態環境中心。生態環境中心與南澳大利亞水務公司共建國際水科學技術中心，與挪威共建中-挪環境綜合研究中心，與橫濱國立大學聯合共建亞洲國際生態環境安全管理中國聯合研究中心，與中國節能投資公司共建中環水務-生態環境中心聯合研發基地，與鹽城、石家莊等共建環保技術研究基地。生態環境中心是農業部批准的農藥登記殘留試驗認證單位之一。
截至2022年底，生態環境中心共有在職職工519人，包括中國科學院院士3人、中國工程院院士2人、發展中國家科學院院士4人，研究員及正高級工程技術人員134人、副研究員及高級工程技術人員150人；“千人計劃”及海外優青12人，中國科學院“百人計劃”入選者27人，傑青23人、優青30人、“萬人計劃”領軍人才9人、青年拔尖人才7人，入選國家“百千萬人才工程”6人。
生態環境中心是國務院學位委員會批准的碩士學位（1980年）、博士學位（1986年）授予單位，是中國科學院博士生重點培養基地。具有環境科學、環境工程、生態學、分析化學、有機化學、環境經濟與環境管理等6個專業博士學位點，環境科學、環境工程、生態學、分析化學、有機化學、環境經濟與環境管理等6個學術型碩士學位點，環境工程、生物工程等2個專業型碩士學位點。設有環境科學與工程、生物學、生態學博士後流動站。1998年被評爲中國科學院博士研究生教育重點培養基地。截至2022年底，共有在學研究生900人，其中碩士生341人（含留學生15人）、博士生559人（含留學生20人）；另有在站博士後250人。
2022年，生態環境中心共有在研項目及課題732項（新增152項）；承擔國家重點研發計劃項目33項（新增9項）、課題105項（新增20項）；承擔國家自然科學基金重大項目及課題18項，國家重大科研儀器研制項目4項，重點項目45項（新增2項），傑出青年科學基金項目26項（新增2項），創新研究群體5項，重大研究計劃21項（新增1項），優秀青年科學基金項目31項（新增3項），面上項目651項（新增48項）；承擔中國科學院戰略先導專項（B類）專項2項、院前沿科學重點研究項目8項、院基礎前沿科學研究計劃“從0到1”原始創新項目3項；承擔改善科研條件專項科研裝備項目6項。
2022年，生态环境中心牵头及合作获得了26项省部级及行业部门重要科技奖励，其中省部级一等奖7项，傅伯杰院士获2022年“发展中国家科学院—联想科学奖”。朱永官院士获2022年国际土壤科学联合会李比希奖。司法鉴定中心和焦文涛研究员分别被评为2021年海淀区“优秀司法鉴定机构”和“优秀司法鉴定人”；生态环境中心有7个学科在ESI进入全球前1%，“环境与生态学”领域名列全球前1‰，在国内位列第一；“中国生态系统管理对碳中和的贡献”入选2022年度中国生态环境十大科技进展；举办首届环境与健康论坛暨Environment & Health新刊发布会；甘露润民团队获中国科学院“科技创新先锋团队”；环境化学第一党支部、水质学第一党支部、生态学第一党支部获得中央和国家机关四强党支部。
2022年，生态环境中心相关技术为水、大气、土壤污染治理提供了重要支撑，环境化学与环境毒理、生态安全格局、生态产品价值（GEP）核算与实现机制等领域的研究取得突破进展。从动物水平揭示了纳米二氧化硅通过吸附并耗竭功能性蛋白质、诱导心血管损伤的新机制，为评估纳米颗粒暴露诱导的心血管毒性效应提供了新的思路；定量揭示了中国生态系统管理对减缓气候变化的贡献，被评价为“对理解自然在中国应对快速气候变化中的作用至关重要”“对发展自然气候解决方案科学具有深远的意义”；牵头完成的《生态产品总值（GEP）核算规范》由国家发改委与国家统计局联合发布在全国应用；受全国人大环资委委托，牵头编制了《青藏高原生态保护法》草案（建议稿）及《青藏高原生态保护法重点问题研究報告》，为青藏高原生态保护的法制化提供了重要支撑；牵头完成国家公园体系规划与试点评估；牵头完成的“黄河流域国家级自然保护区管理成效评估”，为黄河流域自然保护区规范化的建设与管理提供了重要支撑；发现了大气OH自由基生成的新机制，证实黑碳具有重要催化氧化性能，为大气污染控制和大气化学研究提供了新思路；合作研发了满足国六标准的柴油车后处理系统，解决了卡脖子技术难题，在国产柴油车上应用超过20万台，实现了NOx和颗粒物的高效净化；南水北调入京水源安全高效利用技术成果在南水北调干渠和北京市供水系统得到规模化应用，并推广应用于上海等全国82家供水单位，支撑了《生活饮用水卫生标准》（GB5749）等6项国家/行业标准、指南制/修订。
2022年，生態環境中心（第一作者單位）SCI論文1389篇；申請專利220件，其中發明專利198件；獲專利授權127件，其中發明專利104件；出版專著12部。
2022年，生態環境中心國際合作與交流積極推動線下交流活動有序重啓，繼續夯實海外科教基地建設，全力推進後疫情時代國際交流與合作取得突破性進展。派出疫情以來的首個代表團訪問埃及，推動中埃水與環境領域科技合作，被中國駐埃使館評價爲“後疫情時代中埃科技合作的‘破冰之旅’；積極開展與香港特別行政區政府環境保護署在汙水流行病監測研究等方面的科技合作；作爲國家“一帶一路”高質量發展在生態環境領域的重要科技支撐力量，依托“中國科學院-發展中國家科學院水與環境卓越中心”，持之以恒爲解決“一帶一路”沿線國家重大民生問題，政産學研協同推進疫情之下的“一帶一路”水與環境科技合作不斷走向深入外籍專家紮根中心，合作創新成果突出。
2022年，生態環境中心結合區域發展戰略，積極對接地方政府，組織科技成果交流對接與合作，在生態規劃、山水林田湖草沙生態修複、大氣汙染治理、土壤汙染修複和固體廢棄物處理與資源化等方面，通過提供科學高效的科技服務及成果轉化，服務地方高質量綠色發展。比如爲北京、南昌、拉薩等地開展核算並打造服務平台，支撐“綠水青山就是金山銀山”理論踐行和實施；加強與行業龍頭企業的交流與合作，服務行業的轉型升級和可持續發展。比如與國投生物簽署協議，開展生物乙醇重整制氫研究，支撐綠色能源發展和雙碳目標實現。在長江大保護和黃河流域生態修複和高質量發展方面，繼續發揮國家科技戰略力量的支撐作用，繼續牽頭南昌、常德兩座城市的長江大保護駐點跟蹤研究工作，並承擔長江流域突出環境汙染治理與生態修複技術專題的生態環境保護修複綠色低碳關鍵技術篩選與實證課題，同時黃河駐點工作也在積極有序推進。
生態環境中心是中國生態學學會、國際環境問題科學委員會中國委員會的挂靠單位。負責編輯出版Journal of Environmental Sciences（SCI和EI收錄）、《生態學報》《環境科學》《環境科學學報》《環境工程學報》《環境化學》《生態毒理學報》和Ecosystem Health and Sustainability（SCIE收錄）等8種自然科學學術期刊，國際刊物Environmental Science & Technology Asian Office、国际水协会IWA Beijing Office、国际环境问题科学委员会SCOPE Beijing Office设在生态环境中心。2022年，生态环境中心33位科學家分別在國際地理聯合會、太平洋科學協會、國際生態學協會等59個國際重要組織擔任主席、副主席等重要職務，23位科學家在Environmental Science & Technology，Sustainability Science等91個重要國際學術期刊中擔任主編、副主編。
